KDV kanunu 29. maddesinin, 5035 sayılı kanunun 9 uncu maddesiyle değiştirilmiş (Geçerlilik: 01.01.2004, Yürürlük: 02.01.2004) 2. fıkrasına göre, aynı kanunun 28 inci maddesi uyarınca Bakanlar Kurulu tarafından vergi nispeti indirilen teslim ve hizmetlerle ilgili olup teslim ve hizmetin gerçekleştiği vergilendirme döneminde indirilemeyen ve tutarı Bakanlar Kurulunca tespit edilecek sınırı aşan verginin, bu mükelleflerin vergi ve sosyal sigorta prim borçları ile genel ve katma bütçeli idareler ile belediyelere olan borçlarına ya da döner sermayeli kuruluşlar ile sermayesinin % 51'i veya daha fazlası kamuya ait olan veya özelleştirme kapsamında bulunan işletmelerden temin ettikleri mal ve hizmet bedellerine ilişkin borçlarına mahsuben ödenmesi imkanı getirilmişti. Diğer yandan mahsup imkanı mümkün olmayan KDV iade alacakları ise yıllık olarak nakden iade alınabilecektir.
Ancak, gerek 2004 yılına, gerekse 2005 yılına ait Bakanlar Kurulunca tespit edilecek sınırların ilgili yılların tamamlanmasından sonra açıklanmış olması sebebiyle 2004 ve 2005 yılları için indirimli orana tabi işlemlerde aylık iade imkanı mümkün olamamıştır. İadeler zorunlu olarak KDV kanunu 29. madde hükümlerine göre yıllık bazda yapılmak zorunda kalmıştır.
Bakanlar Kurulunun, 06.05.2006 tarihli Resmi Gazete’de yayımlanan 2006/10379 sayılı Kararı ile, yukarıda 29 madde hükmüne uygun olarak iade edileceği açıklanan tutara ilişkin alt sınır 2006 yılı için 10.000 YTL olarak belirlenmiş bulunmaktadır. Kararda, 2007 ve izleyen takvim yılları için bu sınırın, bir önceki yıldaki tutarın, Vergi Usul Kanunu hükümleri uyarınca belirlenen yeniden değerleme oranında artırılması suretiyle uygulanacağı da belirtilmiştir. Bu düzenleme ile bugüne kadar pratikte uygulanamayan indirimli orana tabi işlemlerde aylık iade uygulaması mümkün hale gelmiştir.
Bununla birlikte daha önce yayımlanmış olup indirimli orana tabi teslimler dolayısıyla alınacak KDV iadesi ile ilgili hususları düzenleyen tebliğlerin tamamı yıllık iadeyi baz alarak hazırlanmışlardır. Dolayısıyla aylık iade taleplerinin ne şekilde yerine getirileceğinin usul ve esasları açık olmayıp konu hakkında kısa süre içinde Gelir İdaresi Başkanlığının açıklama yapması beklenmektedir.
Ayrıca sözkonusu aylık iadenin hangi KDV döneminden itibaren aylık olarak gerçekleştirileceği konusunda da tereddüt bulunmaktadır. 2006 yılı başından beri yayımlanması beklenen tebliğin, 2006 yılının başından yayımı tarihine kadar geçen dönemler için de iade uygulamasının mümkün olması gerektiği kanaatindeyiz.
Öte yandan indirimli orana tabi satışları nedeni ile oluşan iade KDV alacaklarını ilgili dönem borçlarına mahsup etmek isteyen mükelleflerin 2006 mayıs dönemi öncelikli olmak üzere her dönem için ayrı olarak aşağıdaki hazırlıkları yapmaları gerekmektedir;
- İlgili dönemdeki indirimli orana tabi teslime konu mal alış faturalarının ve satış faturalarının listesi,
- Aylık indirilecek KDV listeleri (yurtiçi alımlar için ve yurtdışı alımlar (ithalatlar) için ayrı ayrı),
- Aylık iade tutarının hesaplanmasına ilişkin yüklenilen KDV tablosu,
İndirimli orana tabi teslimler dolayısıyla iade edilmesi gereken tutarının ilgili dönem KDV beyannamelerinde gösterilmesi gerektiğinden bu hazırlıkların bir an önce yapılması son derece önem kazanmaktadır.